由于急性附睾炎没有能够及时的进行治疗而发展成为慢性附睾炎，也可能是急性附睾炎的治疗不彻底造成的。一般来说，急性附睾炎迁延不愈2个月以上，极有可能转变为慢性附睾炎。研究发现，因性传播疾病而导致的慢性附睾炎组织中可能普遍存在于男女双方生殖器的人乳头瘤病毒。
慢性附睾炎的病理：
慢性附睾炎可表现为整个附睾由于纤维组织增生而皱缩变硬，有时表现为局灶性硬结形成。组织学上可见到广泛的瘢痕形成，附睾管闭塞，组织中有大量的淋巴细胞和浆细胞浸润。
慢性附睾炎症状：
慢性附睾炎在急性发作期可有局部的疼痛和肿胀，一般无特异性症状，患者主诉多为自行发现阴囊内肿块存在。体检可发现附睾增厚并增大，但无压痛，触诊时极易将肿块与睾丸区分开来。精索增粗，其中输精管的直径增宽，直肠指诊可见前列腺发硬并有纤维化。
慢性附睾炎的诊断和鉴别诊断：
慢性附睾炎没有特异性的诊断方法。慢性附睾炎同时伴有慢性前列腺炎时，前列腺液可发现较多的脓细胞，卵磷脂小体减少。中段尿培养时可培养出各种导致前列腺炎或尿路感染的细菌。确诊依靠病理学检查。超声检查主要表现为附睾增大，内部回声不均且回声增多增强，有时出现线状强回声、形态不规则的强回声光团并后伴声影。CDFI检查血流速度明显低于急性附睾炎患者，而阻力指数高于急性附睾炎患者。鉴别诊断方面主要注意以下几种疾病：
1.附睾结核也有附睾硬结，疼痛，但输精管一般增厚、变硬，有多处硬结，呈串珠样改变。附睾结节一般位于附睾尾部，质硬，不规则。附睾结核的干酪样病变、脓肿容易与阴囊的皮肤粘连，破溃后形成窦道，迁延不愈。尿道分泌物涂片镜检、培养可发现抗酸杆菌，结核菌素试验可为阳性。超声声像图可见附睾结节钙化，其后方可出现声影，且结节血流信号明显缺乏。
2.阴囊内丝虫病，本病虽也有阴囊疼痛，附睾结节，但有丝虫流行区居住史和丝虫感染史，结节常为数个，多在精索下端及附睾头部附近，精索常增厚、迂曲，可并发鞘膜积液。
3.精子肉芽肿本病多见于年轻人，可能是附睾管壁损伤后精子外溢至间质中引起的肉芽肿反应。约一半患者有附睾炎、输精管切除和外伤史。临床症状为局部出现肿痛性包块，部分患者无症状。体检多为位于附睾头部的单个的质硬结节。确诊需病检。
慢性附睾炎的治疗：
单独使用抗生素治疗慢性附睾炎疗效不太理想，还有一定副作用，且不能有效预防复发。
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